Moje CV (w budowie)

Praca

Zainteresowania

  • Systemy dynamiczne
  • Dowody wspierane komputerowo
  • Obliczenia numeryczne, symulacja komputerowa
  • Ścisłe całkowanie równań różniczkowych z opóźnieniem
  • Symulacja molekularna
  • Bioinformatyka

Stypendia / projekty / nagrody

Publikacje w czasopismach

Od najnowszych do starszych

  1. M. Markiewicz; R. Szczelina; B. Milanovič; W. K. Subczyński; M. Pasenkiewicz-Gierula; Chirality affects cholesterol-oxysterol association in water, a computational study, Computational and Structural Biotechnology Journal, Vol. 19, Pages 4319-4335, (2021) [doi:10.1016/j.csbj.2021.07.022]

  2. Szczelina, R.; Baczyński, K.; Markiewicz, M.; Pasenkiewicz-Gierula, M.; Network of lipid interconnections at the interfaces of galactolipid and phospholipid bilayers, Journal of Molecular Liquids, Volume 298, (2020) [doi:10.1016/j.molliq.2019.112002]

  3. Plesnar, E.; Szczelina, R.; Subczynski, K.W.; Pasenkiewicz-Gierula, M.; Is the cholesterol bilayer domain a barrier to oxygen transport into the eye lens?, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes (2018), Vol. 1860, Iss. 2, Pages 434–441, [doi:10.1016/j.bbamem.2017.10.020]

  4. Szczelina, R.; Zgliczyński, P.; Algorithm for rigorous integration of Delay Differential Equations and the computer-assisted proof of periodic orbits in the Mackey-Glass equation, Foundations of Computational Mathematics (2018), Vol. 18, Iss 6, Pages 1299--1332, [Open Access, doi:10.1007/s10208-017-9369-5] [arxiv preprint]

    Kod źródłowy dostępny tutaj

  5. Szczelina, R. A computer assisted proof of multiple periodic orbits in some first order non-linear delay differential equation, Electronic Journal of Qualitative Theory of Differential Equations (2016), No. 83, 1-19, [Open Access, doi:10.14232/ejqtde.2016.1.83] [PDF]

    Kod źródłowy dostępny tutaj

  6. Szczelina, R. Murzyn, K. DMG-α-A Computational Geometry Library for Multimolecular Systems, Journal of Chemical Information and Modeling (2014), 54 (11), 3112–3123 [doi:10.1021/ci500273s]

    Praca zrealizowana ramach grantu NCN: 2011/01/N/ST6/07173. [Strona projektu - dokumentacja]

  7. Szczelina, R. Zgliczyński, P. A Homoclinic Orbit in a Planar Singular ODE---A Computer Assisted Proof, SIAM Journal of Applied Dynamical Systems 12 (2013), 1541-–1565 [doi:10.1137/120901271] [preprint (PDF)]

    Kod źródłowy:

    • Z dołączoną biblioteką CAPD v2.0, bez MSYS: [zip]
    • Z dołaczoną biblioteką CAPD v3.0, kompilacja z MSYS: [zip]
    • Wersja dla nowego CAPD v3.0, tylko kod dowodu: [zip]

Konferencje

  1. SocBiN / BIT Bioinformatics, czerwiec 26 - czerwiec 29, 2013 Toruń, Polska

    Poster: Lipid bilayer analysis using 3D Voronoi diagrams [poster w .PDF]

  2. The 10th AIMS Conference on Dynamical Systems, Differential Equations and Applications, lipiec 07 - lipiec 11, 2014 Madryt, Hiszpania

    Tytuł prezentacji: Rigorous integration of Delay Differential Equations [slajdy w .PDF]

  3. Kongres BIO 2014, wrzesien 9 - wrzesien 12, 2014 Warszawa, Polska

    Poster: DMG-α: computational geometry package for analysis of molecular dynamic simulations [poster w .PDF]

  4. Short Thematic Program on Delay Differential Equations: Differential equations with variable delay, 04-08 maja, 2015 Fields Institute, Toronto, Kanada

    Tytuł prezentacji (na zaproszenie): Rigorous integration of DDEs and applications

  5. Biomolecules and Nanostructures 5, 13-17 maj 2015, Jaroszowice, Poland

    Współautor prezentacji typu invited speaker, referent: Marta Pasenkiewicz-Gierula Self-organisation of cholesterol in water

  6. Dynamics, Topology and Computations (DyToComp), 15-20 czerwiec, 2015 IMPAN Centrum Banacha, Będlewo, Polska

    Tytuł prezentacji: Rigorous integration of delay differential equations and applications

  7. 10th Colloquium on the Qualitative Theory of Differential Equations, 01–04 Lipiec, 2015 Segedyn, Węgry

    Tytuł prezentacji: Constructing Poincaré maps for delay differential equations using rigorous interval arithmetic

  8. 19th IUPAB congress and 11th EBSA congress, 16-20 Lipiec, 2017 Edynburg, Szkocja/Wielka Brytania

    Poster: Computational study of oxygen transport across domains of the membrane of the eye lens fibre cells

  9. 7th Wroclaw-Prague Seminar on Biophysics of Lipids, Wroclaw/Pierwoszow, Polska, 12-14 kwietnia, 2018

    Tytuł prezentacji: Computational study of the oxygen transport across different domains of the membrane of the eye lens fibre cells [slajdy w .PDF]

  10. Dynamics, Topology and Computations (DyToComp), 18-23 czerwiec, 2018 IMPAN Centrum Banacha, Będlewo, Polska

    Tytuł prezentacji: Some developments in rigorous forward in time integration of Delay Differential Equations

  11. 11th Colloquium on the Qualitative Theory of Differential Equations, 17-21 czerwca 2019, Szeged, Węgry

    Tytuł prezentacji: Some improvements in rigorous integration of Delay Differential Equations

  12. Jubileuszowy Zjazd Matematyków Polskich w stulecie PTM, 3-7 września, 2019, UJ / AGH, Krakow, Polska

    Tytuł prezentacji: Ścisłe całkowanie równań różniczkowych z opóźnieniem

Warsztaty

Bierne uczestnictwo w warsztatach i konferencjach naukowych

  1. DyToComp Conference („Dynamics, Topology and Computations”), Będlewo, Poland, 25.06.2012 - 29.06.2012
  2. Tenth Workshop on Interactions between Dynamical Systems and Partial Differential Equations, Universitat Politècnica de Catalunya, Barcelona, Spain, 28.05.2012 – 01.06.2012
  3. Miniconference SSDNM, WMiI UMK Toruń, 13.04.2012 - 14.04.2012
  4. Private Cloud in practice - 8.11.2011, Katowice, Poland
  5. Miniconference SSDNM, WMiI UJ Kraków, 14.10.2011 - 15.10.2011
  6. 9th Workshop on Bioinformatics and 4th Convention of the Polish Bioinformatics Society, 30.09.2011 - 2.10.2011, Kraków, Poland
  7. Modern Dynamics and its Interaction with Analysis, Geometry and Number Theory, week 1, 27.06.2011 - 2.07.2011
  8. Spring School of Dynamical Systems 2011, 05.05.2011 - 08.05.2011
  9. Miniconference SSDNM, WMiI UAM Poznań, 08.04.2011 - 09.04.2011
  10. Introduction to the mathematical theory of compressible fluids – SSDNM seminar and lectures, 2.11.2010 - 5.11.2010
  11. Miniconference SSDNM, IM PAN Warsaw, 08.10.2010 - 09.10.2010